Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VSIG10Q8N0Z9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VSIG10Q8N0Z9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms