Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
APOBEC3FQ8IUX4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC3FQ8IUX4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms