Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D4Q7Z3S7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D4Q7Z3S7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms