Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT89

SLC25A48, Solute carrier family 25 member 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A48Q6ZT89 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC25A48Q6ZT89 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms