Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

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Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
UBR3Q6ZT12 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
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