Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ANKRD40Q6AI12 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD40Q6AI12 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms