Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCERG1LQ5VWI1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TCERG1LQ5VWI1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms