Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms