Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC3LQ5T215 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC3LQ5T215 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms