Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CEP78Q5JTW2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms