Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CAVIN4Q5BKX8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms