Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ODF2Q5BJF6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ODF2Q5BJF6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms