Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COBLL1Q53SF7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLL1Q53SF7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms