Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAB6CQ53S08 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6CQ53S08 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms