Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPRNQ4KMQ1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPRNQ4KMQ1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
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