Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF3Q3KNV8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms