Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPROQ16827 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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