Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTH1Q15438 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CYTH1Q15438 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CYTH1Q15438 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CYTH1Q15438 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
CYTH1Q15438 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CYTH1Q15438 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CYTH1Q15438 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CYTH1Q15438 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH1Q15438 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH1Q15438 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH1Q15438 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH1Q15438 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH1Q15438 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH1Q15438 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH1Q15438 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CYTH1Q15438 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CYTH1Q15438 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH1Q15438 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH1Q15438 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYTH1Q15438 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH1Q15438 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH1Q15438 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH1Q15438 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH1Q15438 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH1Q15438 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH1Q15438 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH1Q15438 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH1Q15438 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH1Q15438 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH1Q15438 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH1Q15438 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CYTH1Q15438 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CYTH1Q15438 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH1Q15438 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH1Q15438 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH1Q15438 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTH1Q15438 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CYTH1Q15438 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH1Q15438 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH1Q15438 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH1Q15438 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH1Q15438 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH1Q15438 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH1Q15438 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH1Q15438 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH1Q15438 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH1Q15438 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CYTH1Q15438 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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