Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TLR1Q15399 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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