Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 TMED9-206ENST00000513799 772 ntTSL 213.07□□□□□ -0.329e-8■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 P4HA2-219ENST00000478055 929 ntTSL 210.57□□□□□ -0.729e-8■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 TMED9-205ENST00000510499 821 ntTSL 210.5□□□□□ -0.739e-8■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 P4HA2-211ENST00000428369 751 ntTSL 210.45□□□□□ -0.749e-8■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 P4HA2-210ENST00000418055 568 ntTSL 58.86□□□□□ -0.999e-8■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 P4HA2-208ENST00000416053 582 ntTSL 37.11□□□□□ -1.279e-8■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.231e-7■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.631e-7■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.741e-7■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.291e-7■■□□□ 11.6
NOLC1Q14978 GLG1-211ENST00000566601 2536 ntTSL 211.75□□□□□ -0.533e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 GLG1-207ENST00000563432 555 ntTSL 38.32□□□□□ -1.083e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 RHOT2-212ENST00000564659 854 ntTSL 217.36■□□□□ 0.372e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.474e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 STX10-210ENST00000591843 1073 ntTSL 519.33■□□□□ 0.684e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.564e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.564e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.544e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 STX10-205ENST00000587318 704 ntTSL 214.78□□□□□ -0.044e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 STX10-211ENST00000593126 713 ntTSL 313.8□□□□□ -0.24e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 RAD21-201ENST00000297338 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.564e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 GARS-205ENST00000470392 469 ntTSL 54.85□□□□□ -1.634e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 KPNB1-212ENST00000582126 653 ntTSL 515.56■□□□□ 0.082e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.969e-10■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 UBB-209ENST00000614404 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.439e-10■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 UBB-202ENST00000395837 1014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.79e-10■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 UBB-208ENST00000578706 500 ntTSL 36.75□□□□□ -1.339e-10■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.097e-8■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 ST13-201ENST00000216218 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.227e-8■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 PTPRF-206ENST00000429895 6312 ntTSL 1 (best)17.32■□□□□ 0.361e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 FBLN1-211ENST00000451475 544 ntTSL 516.91■□□□□ 0.32e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 FBLN1-206ENST00000437711 753 ntTSL 516.51■□□□□ 0.232e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 PTPRF-215ENST00000496447 5887 ntTSL 1 (best)14.9□□□□□ -0.021e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 FBLN1-216ENST00000465578 481 ntTSL 513.81□□□□□ -0.22e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 FBLN1-215ENST00000460538 543 ntTSL 213.69□□□□□ -0.222e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 PTPRF-205ENST00000414879 4836 ntTSL 213.38□□□□□ -0.271e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 PTPRF-203ENST00000372407 4600 ntTSL 213.14□□□□□ -0.311e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 PTPRF-204ENST00000412568 4154 ntTSL 512.81□□□□□ -0.361e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.157e-14■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 KRT8-206ENST00000546900 523 ntTSL 321.65■■□□□ 1.067e-14■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 GSN-202ENST00000373807 2823 ntTSL 221.47■■□□□ 1.031e-9■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 KRT8-213ENST00000550170 2202 ntTSL 521■□□□□ 0.957e-14■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.887e-14■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 KRT8-210ENST00000548998 918 ntTSL 519.88■□□□□ 0.777e-14■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 KRT8-204ENST00000546826 1165 ntTSL 518.92■□□□□ 0.627e-14■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.567e-14■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 KRT8-208ENST00000547031 883 ntTSL 217.86■□□□□ 0.457e-14■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.47e-14■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 KRT8-203ENST00000546583 2862 ntTSL 516.99■□□□□ 0.317e-14■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 KRT8-209ENST00000547176 250 ntTSL 515.06■□□□□ 07e-14■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 KRT8-211ENST00000549176 770 ntTSL 212.24□□□□□ -0.457e-14■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.384e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.164e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.034e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 NRDC-203ENST00000440943 1660 ntTSL 58.55□□□□□ -1.044e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 NRDC-210ENST00000485608 3149 ntTSL 28.02□□□□□ -1.134e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.254e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 KPNB1-201ENST00000290158 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.531e-6■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.344e-9■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.244e-9■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 DEK-204ENST00000505224 1372 ntTSL 215.28■□□□□ 0.044e-9■■□□□ 11.5
NOLC1Q14978 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.951e-323■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 HMGCR-201ENST00000287936 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.534e-6■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 HMGCR-202ENST00000343975 3681 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.984e-6■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.044e-6■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 HMGCR-213ENST00000515776 501 ntTSL 24.64□□□□□ -1.674e-6■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.529e-9■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 SND1-212ENST00000485871 597 ntTSL 312.32□□□□□ -0.442e-39■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 FGA-203ENST00000622532 1130 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.668e-24■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 FGA-202ENST00000403106 2248 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.728e-24■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.048e-24■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC14.07□□□□□ -0.167e-23■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 HINT1-202ENST00000504202 619 ntTSL 54.3□□□□□ -1.722e-11■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 ALB-212ENST00000507673 262 ntTSL 25.04□□□□□ -1.61e-323■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.675e-8■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 P4HA2-209ENST00000417528 1023 ntTSL 318.47■□□□□ 0.555e-8■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.445e-8■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 P4HA2-204ENST00000379100 2563 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.255e-8■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 P4HA2-205ENST00000379104 2569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.255e-8■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 P4HA2-206ENST00000395164 568 ntTSL 413.47□□□□□ -0.255e-8■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 P4HA2-213ENST00000431054 724 ntTSL 413.15□□□□□ -0.35e-8■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 P4HA2-207ENST00000401867 3349 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.455e-8■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 P4HA2-203ENST00000379086 2223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.465e-8■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 P4HA2-214ENST00000439698 866 ntTSL 511.95□□□□□ -0.55e-8■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.671e-9■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 ILF3-221ENST00000591649 2579 ntTSL 217.35■□□□□ 0.371e-9■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 01e-9■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 ILF3-208ENST00000587928 4230 ntTSL 212.59□□□□□ -0.391e-9■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 ILF3-205ENST00000586544 3859 ntTSL 1 (best)12.07□□□□□ -0.481e-9■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 GSN-207ENST00000432226 1042 ntTSL 518.87■□□□□ 0.612e-15■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 GSN-212ENST00000477863 716 ntTSL 417.4■□□□□ 0.382e-15■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 GSN-210ENST00000477104 806 ntTSL 416.6■□□□□ 0.252e-15■■□□□ 11.4
NOLC1Q14978 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.531e-7■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.441e-6■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31e-6■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.181e-6■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 ANKRD17-207ENST00000558247 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)7.27□□□□□ -1.251e-6■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 MAN2A2-202ENST00000557865 2671 ntTSL 216.35■□□□□ 0.218e-8■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 ZRANB2-202ENST00000370920 3078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.633e-8■□□□□ 11.3
NOLC1Q14978 MAN2A2-207ENST00000558374 731 ntTSL 37.89□□□□□ -1.158e-8■□□□□ 11.3
Retrieved 100 of 7,921 protein–RNA pairs in 89.1 ms