Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BECN1Q14457 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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