Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDE7AQ13946 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE7AQ13946 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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