Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP1A4Q13733 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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