Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR4Q13639 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR4Q13639 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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