Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TCIRG1Q13488 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCIRG1Q13488 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
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