Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MKRN4PQ13434 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MKRN4PQ13434 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
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