Protein–RNA interactions for Protein: Q13395

TARBP1, Probable methyltransferase TARBP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1Q13395 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TARBP1Q13395 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC35■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC35■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC35■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TARBP1Q13395 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
TARBP1Q13395 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
TARBP1Q13395 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
TARBP1Q13395 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TARBP1Q13395 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TARBP1Q13395 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TARBP1Q13395 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
TARBP1Q13395 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
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