Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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SKP2Q13309 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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SKP2Q13309 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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SKP2Q13309 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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SKP2Q13309 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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SKP2Q13309 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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