Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SRSF6Q13247 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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