Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKRN3Q13064 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN3Q13064 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
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