Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPN13Q12923 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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