Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFEMP1Q12805 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
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