Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TWF1Q12792 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TWF1Q12792 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms