Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 EAF7YNL136W 1278 nt1.91□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 ESF2YNR054C 951 nt1.91□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt1.91□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 HOP1YIL072W 1818 nt1.91□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.9□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.9□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.9□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.9□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.9□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.9□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.9□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.9□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 VPH2YKL119C 648 nt1.9□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 COS3YML132W 1140 nt1.9□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 TAF14YPL129W 735 nt1.9□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 COS2YBR302C 1140 nt1.9□□□□□ -2.1
TY2B-BQ12491 PLP1YDR183W 693 nt1.9□□□□□ -2.11
TY2B-BQ12491 YJR061WYJR061W 2808 nt1.89□□□□□ -2.11
TY2B-BQ12491 UTP20YBL004W 7482 nt1.89□□□□□ -2.11
TY2B-BQ12491 MCM21YDR318W 1107 nt1.89□□□□□ -2.11
TY2B-BQ12491 UBC6YER100W 753 nt1.89□□□□□ -2.11
TY2B-BQ12491 GRX1YCL035C 333 nt1.89□□□□□ -2.11
TY2B-BQ12491 MRPL9YGR220C 810 nt1.88□□□□□ -2.11
TY2B-BQ12491 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt1.88□□□□□ -2.11
TY2B-BQ12491 SIP4YJL089W 2490 nt1.88□□□□□ -2.11
TY2B-BQ12491 PKH3YDR466W 2697 nt1.87□□□□□ -2.11
TY2B-BQ12491 UBR1YGR184C 5853 nt1.87□□□□□ -2.11
TY2B-BQ12491 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.87□□□□□ -2.11
TY2B-BQ12491 IRC21YMR073C 606 nt1.87□□□□□ -2.11
TY2B-BQ12491 MRPL27YBR282W 441 nt1.87□□□□□ -2.11
TY2B-BQ12491 YCK3YER123W 1575 nt1.87□□□□□ -2.11
TY2B-BQ12491 UTP13YLR222C 2454 nt1.86□□□□□ -2.11
TY2B-BQ12491 YLR345WYLR345W 1530 nt1.86□□□□□ -2.11
TY2B-BQ12491 snR3snR3 194 nt1.86□□□□□ -2.11
TY2B-BQ12491 RLI1YDR091C 1827 nt1.86□□□□□ -2.11
TY2B-BQ12491 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.85□□□□□ -2.11
TY2B-BQ12491 CTM1YHR109W 1758 nt1.85□□□□□ -2.11
TY2B-BQ12491 CDC53YDL132W 2448 nt1.85□□□□□ -2.11
TY2B-BQ12491 FYV8YGR196C 2454 nt1.85□□□□□ -2.11
TY2B-BQ12491 AEP2YMR282C 1743 nt1.85□□□□□ -2.11
TY2B-BQ12491 CTP1YBR291C 900 nt1.85□□□□□ -2.11
TY2B-BQ12491 CCM1YGR150C 2595 nt1.84□□□□□ -2.11
TY2B-BQ12491 TOM70YNL121C 1854 nt1.84□□□□□ -2.11
TY2B-BQ12491 DDI2YFL061W 678 nt1.84□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 FMP48YGR052W 1110 nt1.84□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 DCG1YIR030C 735 nt1.84□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 SHE2YKL130C 741 nt1.84□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 RPL33BYOR234C 324 nt1.84□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 SUR1YPL057C 1149 nt1.84□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 AFI1YOR129C 2682 nt1.84□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt1.83□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 RPN9YDR427W 1182 nt1.83□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 MIG1YGL035C 1515 nt1.83□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 YJR003CYJR003C 1560 nt1.83□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 KCS1YDR017C 3153 nt1.83□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 INP51YIL002C 2841 nt1.83□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 YOR029WYOR029W 336 nt1.82□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 VPS15YBR097W 4365 nt1.82□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt1.82□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 YHI9YHR029C 885 nt1.82□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 RPS29AYLR388W 171 nt1.82□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 IST1YNL265C 897 nt1.82□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 MSN5YDR335W 3675 nt1.82□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 REG1YDR028C 3045 nt1.82□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 MES1YGR264C 2256 nt1.82□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 IOC4YMR044W 1428 nt1.81□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 OCT1YKL134C 2319 nt1.8□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 MIC60YKR016W 1623 nt1.8□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 LIP2YLR239C 987 nt1.8□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 BEM2YER155C 6504 nt1.8□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 ZRG17YNR039C 1818 nt1.8□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 YCR050CYCR050C 309 nt1.8□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 YER023C-AYER023C-A 213 nt1.8□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 COS6YGR295C 1146 nt1.8□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 TOM1YDR457W 9807 nt1.79□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 KEI1YDR367W 666 nt1.79□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 AAR2YBL074C 1068 nt1.79□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 DSE4YNR067C 3354 nt1.79□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 RGP1YDR137W 1992 nt1.79□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 SPO13YHR014W 876 nt1.78□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 HIT1YJR055W 495 nt1.78□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 YOR292CYOR292C 930 nt1.78□□□□□ -2.12
TY2B-BQ12491 QCR9YGR183C 201 nt1.77□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 SPO22YIL073C 2928 nt1.77□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 SOK1YDR006C 2706 nt1.77□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 CNM67YNL225C 1746 nt1.77□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 PRP38YGR075C 729 nt1.77□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 ERP1YAR002C-A 660 nt1.77□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt1.76□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt1.76□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 YCL019WYCL019W 5313 nt1.76□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 NPR1YNL183C 2373 nt1.76□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 IPT1YDR072C 1584 nt1.76□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 SPH1YLR313C 1593 nt1.76□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 YDL073WYDL073W 2955 nt1.76□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 YER085CYER085C 522 nt1.76□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.76□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.76□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 PRM2YIL037C 1971 nt1.76□□□□□ -2.13
TY2B-BQ12491 RPN5YDL147W 1338 nt1.76□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.9 ms