Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms