Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIPPLY1Q0D2K3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIPPLY1Q0D2K3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms