Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXM1Q08050 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXM1Q08050 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXM1Q08050 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXM1Q08050 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXM1Q08050 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXM1Q08050 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXM1Q08050 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXM1Q08050 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXM1Q08050 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXM1Q08050 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXM1Q08050 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXM1Q08050 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXM1Q08050 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXM1Q08050 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXM1Q08050 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXM1Q08050 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXM1Q08050 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXM1Q08050 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXM1Q08050 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms