Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CXCL9Q07325 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CXCL9Q07325 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms