Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms