Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms