Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POU5F1Q01860 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
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