Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
XPCQ01831 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
XPCQ01831 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
XPCQ01831 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
XPCQ01831 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
XPCQ01831 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
XPCQ01831 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
XPCQ01831 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
XPCQ01831 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
XPCQ01831 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
XPCQ01831 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
XPCQ01831 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
XPCQ01831 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
XPCQ01831 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
XPCQ01831 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
XPCQ01831 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
XPCQ01831 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
XPCQ01831 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
XPCQ01831 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
XPCQ01831 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
XPCQ01831 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
XPCQ01831 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
XPCQ01831 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
XPCQ01831 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
XPCQ01831 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
XPCQ01831 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XPCQ01831 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
XPCQ01831 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
XPCQ01831 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
XPCQ01831 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
XPCQ01831 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XPCQ01831 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XPCQ01831 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XPCQ01831 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
XPCQ01831 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XPCQ01831 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
XPCQ01831 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
XPCQ01831 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
XPCQ01831 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
XPCQ01831 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
XPCQ01831 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XPCQ01831 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
XPCQ01831 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
XPCQ01831 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
XPCQ01831 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
XPCQ01831 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
XPCQ01831 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
XPCQ01831 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
XPCQ01831 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
XPCQ01831 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
XPCQ01831 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
XPCQ01831 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
XPCQ01831 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
XPCQ01831 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
XPCQ01831 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
XPCQ01831 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
XPCQ01831 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
XPCQ01831 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
XPCQ01831 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
XPCQ01831 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
XPCQ01831 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
XPCQ01831 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
XPCQ01831 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
XPCQ01831 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
XPCQ01831 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
XPCQ01831 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
XPCQ01831 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
XPCQ01831 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
XPCQ01831 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
XPCQ01831 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
XPCQ01831 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
XPCQ01831 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
XPCQ01831 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
XPCQ01831 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
XPCQ01831 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
XPCQ01831 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
XPCQ01831 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
XPCQ01831 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
XPCQ01831 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
XPCQ01831 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
XPCQ01831 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
XPCQ01831 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
XPCQ01831 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
XPCQ01831 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
XPCQ01831 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
XPCQ01831 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
XPCQ01831 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
XPCQ01831 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
XPCQ01831 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
XPCQ01831 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
XPCQ01831 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
XPCQ01831 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
XPCQ01831 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
XPCQ01831 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
XPCQ01831 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
XPCQ01831 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
XPCQ01831 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
XPCQ01831 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
XPCQ01831 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
XPCQ01831 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms