Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE1BQ01064 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms