Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HSF1Q00613 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms