Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRPS9P82933 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MRPS9P82933 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MRPS9P82933 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPS9P82933 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPS9P82933 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPS9P82933 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPS9P82933 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPS9P82933 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPS9P82933 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPS9P82933 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPS9P82933 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPS9P82933 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPS9P82933 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPS9P82933 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPS9P82933 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRPS9P82933 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms