Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLDN10P78369 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms