Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2FP61218 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2FP61218 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms