Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVFC1-1P60608 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms