Protein–RNA interactions for Protein: P60510

PPP4C, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4CP60510 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPP4CP60510 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP4CP60510 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms