Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTSWP56202 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTSWP56202 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTSWP56202 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CTSWP56202 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTSWP56202 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTSWP56202 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTSWP56202 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTSWP56202 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTSWP56202 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTSWP56202 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTSWP56202 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTSWP56202 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTSWP56202 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTSWP56202 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTSWP56202 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTSWP56202 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTSWP56202 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTSWP56202 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CTSWP56202 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CTSWP56202 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTSWP56202 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTSWP56202 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTSWP56202 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTSWP56202 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTSWP56202 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CTSWP56202 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTSWP56202 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTSWP56202 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTSWP56202 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTSWP56202 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTSWP56202 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTSWP56202 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTSWP56202 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTSWP56202 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTSWP56202 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTSWP56202 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTSWP56202 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTSWP56202 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTSWP56202 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTSWP56202 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTSWP56202 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTSWP56202 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTSWP56202 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTSWP56202 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTSWP56202 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTSWP56202 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTSWP56202 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTSWP56202 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTSWP56202 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTSWP56202 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTSWP56202 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTSWP56202 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTSWP56202 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTSWP56202 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTSWP56202 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTSWP56202 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTSWP56202 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTSWP56202 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTSWP56202 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTSWP56202 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTSWP56202 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTSWP56202 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTSWP56202 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTSWP56202 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTSWP56202 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTSWP56202 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CTSWP56202 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTSWP56202 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTSWP56202 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CTSWP56202 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTSWP56202 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTSWP56202 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTSWP56202 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTSWP56202 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTSWP56202 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTSWP56202 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTSWP56202 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTSWP56202 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTSWP56202 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTSWP56202 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTSWP56202 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTSWP56202 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTSWP56202 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTSWP56202 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTSWP56202 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTSWP56202 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTSWP56202 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTSWP56202 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTSWP56202 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTSWP56202 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTSWP56202 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTSWP56202 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTSWP56202 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTSWP56202 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTSWP56202 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTSWP56202 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTSWP56202 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTSWP56202 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTSWP56202 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms